Oddělení meteorologie se zaměřuje na měření meteorologických prvků v okrese Bruntál a jejich vliv na vodní toky (např. koncentrace znečišťujících látek, průtok nebo výška hladiny). Vytváříme síť meteorologických a hydrologických stanic, abychom získávali data pravidelně i několikrát denně. Meteorologické stanice jsou vybaveny čidly pro měření teploty a vlhkosti vzduchu, množství srážek, rychlosti a směru větru a atmosférického tlaku. V případě potřeby mohou být stanice doplněny o senzory pro měření intenzity slunečního záření, teploty a vlhkosti půdy nebo detekci blesků. Hydrologické stanice obsahují čidla potřebná pro výzkum meteorologie i znečištění vodních toků, jako jsou senzory teploty vody, výšky hladiny a elektrické vodivosti vody. V případě potřeby mohou být stanice doplněny o čidla pH vody nebo oxidačně-redukčního potenciálu.